市、县区交通运输局对落实全面从严治党主体责任研究谋划少，措施不够有力，班子成员“一岗双责”意识不强，对分管领域党风廉政建设工作重视不够，责任和压力传导层层递减；干部队伍凝聚力向心力不强，有的干部服务意识淡薄，庸懒散拖，怕担责、不作为，行业监管职责缺失,建设项目管理不规范;财务管理制度落实不力，资金使用审核把关不严。运管行业深层次问题较多，但研究解决问题的措施办法不多。
市交通运输局：对贯彻落实中央八项规定精神不够重视，违反中央八项规定精神的问题时有发生；个别领导干部责任担当意识不强，对下属单位管理不严格；科室之间工作衔接不够，工作效率较低。
甘州区交通运输局：存在擅自调整工程建设项目内容、违规罚款、挤占挪用资金、无依据收费等问题。
临泽县交通运输局：存在工程建设项目管理滞后、所属公司借用资质参与招投标和分包工程等问题。
高台县交通运输局：存在对水运安全监管不力、路政监管不到位、行业协会违规收费等问题。
山丹县交通运输局：存在建制村通畅工程质量不高、无依据罚款和专项存量资金未及时上缴财政等问题。
民乐县交通运输局：存在干部职工学习流于形式、乡村道路养护不到位、违规下达罚款任务等问题。
肃南县交通运输局：存在挪用工程专项资金、项目工程进展缓慢等问题。